本系擁有最完整的發酵工程試量產工廠，為全國少數擁有噸級發酵槽的學校，工廠內重要設備尚包括：攪拌式發酵槽(5L, 100L)、氣舉式發酵槽、連續式試量產級增壓超音波破菌機、連續式試量產級蝶式高速離心機、板框式過濾器、試量產級冷凍乾燥機、試量產級噴霧造粒乾燥機、膠囊充塡機、連續式磨粉機、超臨界萃取設備、萃取濃縮機、啤酒釀造設備、無菌無塵組合工作站。